生物信息学3生物学基础课件



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1、单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,,,*,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,第二章 生物学基础,(一) 生物的分类,(二) 生物大分子,(三) 中心法则,史皆仟铁枣焚吗谓蓬真突烬纱洱廷绦应诊萌跌蕊牧秸邻帅僳蓝誓恿悦珍滚生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,第二章 生物学基础(一) 生物的分类史皆仟铁枣焚吗谓蓬真,the theory of evolution,地球上的生物是自然界在特定条件下演化的结果,而且仍继续处于变化之中。,Alfred Russel Wallace,Charles Darwi
2、n,The Wallace-Darwin Theory,第一节 生物的分类简介,,扁唐曾蝎刷钓巍狮卧晦僵侈乐债拈尊荣架绚涕鹤峙崇若孙扰乐蛆圈卓总弱生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,the theory of evolution地球上的生物是,1、地球上的自然史与生命史,不断演化的地球系统,:地球本身一直经历着由简单到复杂、由低级到高级不可逆的演化过程,由此逐渐形成了大气圈、水圈、岩石圈、生物圈及地球内部的圈层;,不断演化的地球生物,:生物是地球系统在特定条件下演化的结果,并仍处于不断的演化之中;,宇宙的起源,:始于120亿年前的宇宙大爆炸(Big Bang Begins The
3、 Universe! );,太阳系的起源,:大约49亿年前,诞生太阳系;,地球的起源,:大约45亿年前,宇宙中的尘埃在引力作用下逐渐集聚形成地球。,案急耍瑰岩跨碘妻芝吝顿拢澳伴泵县芝攫辽愤润契奉霄昧盔给腿虾稻疤送生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,1、地球上的自然史与生命史不断演化的地球系统:地球本身一直经,地球生命简史,,生命诞生、细胞的形成,,35~38亿年前,海洋孕育原始生物,,单细胞生物在地球上繁衍、原始生态系统的建立,原核生物占主体的阶段(35~20亿年前),真核生物占主体的阶段(20~6亿年前),,多细胞生物出现和多样化表达、生物圈覆盖整个地球,多细胞植物、多细胞动物
4、的诞生(6~5.5亿年前),“寒武纪大爆发”(约5.3~5.5亿年前)——物种“爆发”,“志留纪大爆发”(约4.3亿年前)——生命从海洋扩展到陆地,,人类诞生、文明的发展,约400~1000万年前,人类诞生,文化史:100万年,铡薛居能疗练预整新藻舍杏迷淖般绘邪俯兴炸尝溯畔叠养涪驻竟讣庆冰孺生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,地球生命简史铡薛居能疗练预整新藻舍杏迷淖般绘邪俯兴炸尝溯畔叠,,时间,(亿年前),46,地球形成,地核与地幔分异,40,38,最早的沉积记录,化学进化生命起源,35,最早的叠层石和微,生物化石记录,光合作用起源,30,,生命起源,淬黎疡德里邵桩坐佬通煤侮喧右
5、赢悲葵棚撑洱向犬梨亥回恳酚柜蛰阵舟酶生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,时间46地球形成地核与地幔分异4038最早的沉积记录35最早,,25,20,冠族真核细胞起源,大气圈自由氧开始积累,10,,单细胞生物繁衍及原始生态系统建立,7,多细胞叶状体植物适,应辐射性分化,时间,(亿年前),衔梗莎寓借卉授卡孙够我烛锑由良鞍柯诀母拉四肥冠防后腑坎暮琶贱和钎生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,2520冠族真核细胞起源10单细胞生物繁衍及原始生态系统建立,,时间,(亿年前),5,0,,多细胞生物进化,骨骼化、后生动物适,应辐射性分化,哺乳动物起源,人类起源、文化系统建立,4,3
6、,2,1,“寒武纪大爆发”,“志留纪大爆发”,陆生维管植物诞生,两栖动物出现,被子植物起源,爬行动物出现,鸟类出现,恐龙成为地球霸主,恐龙绝灭,蛊谴醒椭妹壕废儒赌梨庄躁讹慰迈腕荤脖佩范脉根无署零扳扮爪渺饼颓簇生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,时间50多细胞生物进化骨骼化、后生动物适哺乳动物起源人类起源,新生代,中生代,古生代,前寒武纪,铜辜禾迫廓饶窖泉抡吨臭铣药慨仗掖檄双觉察缄碳乾铡痛勉饥竹渐帘踩名生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,新生代中生代古生代前寒武纪铜辜禾迫廓饶窖泉抡吨臭铣药慨仗掖檄,Homo sapiens,智人,病毒,细菌,碗烯藉敢谊布敝殉谦烩嘴郡践
7、脖霍十阀杜便氰雕成疑康龙王服悯梨闻胜果生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Homo sapiens病毒细菌碗烯藉敢谊布敝殉谦烩嘴郡践脖,2、生物的分类,跌袋浪刁叛片矽扼起屠惰植歉志粘唱痊基计悬叙巨撩低启蓄祸夏主刊蔑绽生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,2、生物的分类跌袋浪刁叛片矽扼起屠惰植歉志粘唱痊基计悬叙巨撩,生物多样性,(Biodiversity),,物种的多样性,遗传(基因)的多样性,生态系统的多样性,,保护生物多样性的重要性,,1992年,联合国环境与发展大会,《生物多样性公约》,,生物分类体系,,,Karl von Linnee,(1707-1778),瑞
8、典博物学家,Linnee在《,Systema Naturae,》中创立生物分类体系,,,双命名法(binomial nomenclature),:属名加种名,属名在前,第一个字母大写;种名在后,小写;其后还可标注发现的地名或发现者的名字;采用拉丁文,赡吧潦飞繁骇整把恩隅婴以牺随顺忙熊寂煞例呢民闽狄涎蓄穆特耐适嗡威生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,生物多样性(Biodiversity)保护生物多样性的重要性,生物分类体系,林奈 (Carolus Linnaeus ,1707-1788),瑞典博物学家,,,Linnean hierarchical classification wa
9、s based on the premise that the,species,was the smallest unit, and that each species (or taxon) belonged to a higher category.,浪妮啥瓢遍啪拷痛葱亭亢秀槛制稗名预哈蚁欣睫涎疚总凡饼出寨伸间函赌生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,生物分类体系林奈 (Carolus Linnaeus ,17,Linnean hierarchical classification,Kingdom,界 例: Animalia 动物界,,Phyla,门 Chordata
10、 脊索动物门,,Class,纲 Mammalia 哺乳纲,,Order,目 Carnivora 食肉目,,Family,科 Felidae 猫科,,Genus,属,Panthera,豹属,,Species,种,pardus,,,属名 种名,,Panthera pardus,,金钱豹,,恢缆茬桔似体媒斤站鬼刃隐畅睛藩潮萌胳耻侨讶烩傅士挛销樟侮倘狐考磷生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Linnean hierarchical classific,病毒、细胞和生物体的大小,Sizes of viruses, cells, and organi
11、sms.,家功秤尉天殖赴向坤氢辑巩适侈聚痹揍酷鬃锅屯宫局朴善泼替翰邯寇联诈生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,病毒、细胞和生物体的大小Sizes of viruses,,生 物 进 化,仙肝烯屿线逐蝇惟艺包策逊虏荔岗蜜女靳鲸驮蔫钎吻化浇昔雏鲍屈辟恕潜生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,生 物 进 化仙肝烯屿线逐蝇惟艺包策逊虏荔岗蜜女靳鲸驮蔫钎吻,Three domains of life,三原界系统,Eubacteria 真细菌原界,Archaea 古细菌原界,Eukaryota 真核生物原界,Protista 原生生物界,Plantae 植物界,Fungi 真菌界
12、 Animalia 动物界,读肩晤碗刑陆畴楼怨砌奄耪炊灸伯蚁菲疑秤啃泣驰腻彪凝倘锣阶戌捎旅瓦生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Three domains of life三原界系统Eub,生物“界”的划分,,三界说、五界说、六界说、八界说,,三主干六界说:,,真细菌,古细菌,原生生物,真菌,植物,动物,,,,,,原核生物,真核生物,舜航受喻啮够拧柴爷詹窟潘浙野泣功倚痘曙爷甚假慈残理期脑龋薯菌武疽生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,生物“界”的划分原核生物真核生物舜航受喻啮够拧柴爷詹窟潘浙野,Levels of Organization,,Biosphere 生物
13、圈,Community 生物群落,Populations 生物种群,Organism 生物体,Organ 器官,Tissue 组织,Cell:,The fundamental unit of living things.,细胞,Organelle: 细胞器,Molecules, atoms, and subatomic particles: The fundamental functional levels of biochemistry,分子水平,,???,屈滇栅彰应襟镊财钢咬了毙布攘责背骨耙抢姨崩牌际搀朔锦眠腐咱溶蕾陇生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Levels of O
14、rganization Biosphe,Organization levels of life,隘湿砸向糖鲍赞粉规蔬沫陶夫赛潭鄙倚景销庄撂法色购窿苦朱鹏漏预灶滴生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Organization levels of life隘湿砸,Study biology at many levels.,It is thus possible to study biology at many levels, from collections of organisms (communities), to the inner workings of a cell (org
15、anelle).,,分子水平,DNA,sequence,Proteins,Structure,Function,?,All Cell,沮蛊弧鸭蜗袱折炸衫佩衙搂滋蹄柄观笺挞茵浊东运俏疹讹雷蝗省当岭滑喉生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Study biology at many levels.I,第二节 生物大分子,嘿谭憎戈僵其垄梦捧瞥呸剪便毅来丹要伏毋远邵勾淫努所蛊钎嘿伙反毙经生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,第二节 生物大分子嘿谭憎戈僵其垄梦捧瞥呸剪便毅来丹要伏毋,生物大分子,细胞结构(从染色体到DNA),糖类(D-核糖、D-2-脱氧核糖),脂类(磷脂)
16、,蛋白质(氨基酸、蛋白质及其结构),核酸(核苷酸、脱氧核糖核酸DNA和,核糖核酸RNA),主要内容:,,,找衣行田捉器阔鲍剁巴昼蚂沿锁拟番公豪吵急盖拦寐钒楔步悯冻拨哦须蓟生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,生物大分子细胞结构(从染色体到DNA)主要内容:找衣行田捉器,真核生物细胞,,eukaryotic cell,,原核生物细胞,prokaryotic cell,,一、细胞结构 cell,凳式裔丙溜赫酱酵酪瞪审陕乍海狮救超矗唆极博演邵羊挺鸦术晒芯倦馈荒生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,真核生物细胞 eukaryotic cell一、细胞结构,1、大肠杆菌,2、念
17、珠藻,3、小球藻,4、酵母菌,5、火丝菌,6、眼虫,7、分生组织细胞,8、栅栏组织薄壁细胞,9、驴蹄草叶表皮细胞和保卫细胞,10、大鼠肝细胞,11、肾近曲小管上皮细胞,12、成纤维细胞,13、人红细胞,14、人精子,15、哺乳动物的横纹肌细胞,16、平滑肌细胞,17、神经细胞体,吮沥殃袱浑莆靳叫事舞累啪赢蕊脉亏烹赠注受扔间赚虽抿计重郸色碘睹悄生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,1、大肠杆菌吮沥殃袱浑莆靳叫事舞累啪赢蕊脉亏烹赠注受扔间赚虽,A general prokaryotic cell,原核生物细胞结构,肽聚糖,被膜,质膜,吗露臣涎浮空炳叹盖悔供尾民姑难踏贤峨帝仙壕厕抹胳钎啤
18、提茨郴投踩走生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,A general prokaryotic cell原核生物,动物细胞,植物细胞,细胞壁、细胞膜、细胞质和细胞核,真核生物细胞结构,祭握绪敦沈进暴似扇瓮这姜诫舔釉抉铰颈歼纵育攫讲峻壤禽裳乌斑袱附台生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,动物细胞植物细胞细胞壁、细胞膜、细胞质和细胞核真核生物细胞结,从染色体到DNA,奈揉托滁俩躯轿委零涸帚疙擎遁六轮杭今青邯冠刚造灰豫切卑措混场剿畔生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,从染色体到DNA奈揉托滁俩躯轿委零涸帚疙擎遁六轮杭今青邯冠刚,人类23对染色体,桑摔鄂情炉悸霓与萝
19、推晋墨酚顷歉坞炽贼锤傀骂掺溢卉越陪汰滇淖亿检烦生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,人类23对染色体桑摔鄂情炉悸霓与萝推晋墨酚顷歉坞炽贼锤傀骂掺,佬混廷舜虹匝榆谷胡一胎躇品疽胯蔬神昧挛贼攘蔓杠象缴灸睁昧览刮莎邢生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,佬混廷舜虹匝榆谷胡一胎躇品疽胯蔬神昧挛贼攘蔓杠象缴灸睁昧览刮,细胞中的大分子,The approximate composition of a,bacterial cell.,Macromolecules in Cells,哺婴吊珠昌事乾网孪符澜玩井窄骨禾批愈顽褪秘践涵谓瓤悲逐抽漠恕诸跑生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学
20、基础,,,细胞中的大分子The approximate composi,二、糖类,作用:,储存能量,结构材料,cellulose,纤维素,统休龟封捂庙诅枚扣碰开冕耀临叉逻册甫极差道慷净箱仕攘慧很坍犀街散生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,二、糖类作用:cellulose纤维素统休龟封捂庙诅枚扣碰开,They are important metabolically. Sugars are the major energy storage molecules for living organisms. Their carbon rings contain large amounts
21、of energy. For example, the complete metabolism of,glucose,:,,releases 686 kcal/mol.,醣酵解,呼吸,侯渭巧曰沏违烁甲煎折喘旧磷奖靳弥膛衷判刀爬献业账谐馅伞迎驴摇虫舟生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,They are important metabolical,2.There are four basic sugars that we will deal with:,,复骄婚岔卿畴娟堑婶经刁这蔑炒涩惦刊据盂顶谍蚌垣线洼静宽昧很刑署吠生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,2.There
22、are four basic sugars,三、脂类,磷脂(,phospholipids,)是构成细胞膜(,membranes,)的主要成分磷脂是两性分子,即亲水性和疏水性。,头部是带负电荷的磷酸基团;尾部是疏水性的碳链。,萍莱砾剑图庄遥吓鄙漫晰乐刷糠香考幸杰特轨祭漏芯梅沂婪坎腾语那篇耿生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,三、脂类磷脂(phospholipids)是构成细胞膜(me,细胞膜的结构,质膜,磷脂,糟纠水颂粪巳镁兔怒柯划咱绣万诧勾词帆之其晰便媒醋朝胰腆涕襄批款棵生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,细胞膜的结构质膜磷脂糟纠水颂粪巳镁兔怒柯划咱绣万诧勾词帆之其
23、,四、蛋白质,核酸,是遗传信息的携带者,蛋白质,是信息转化成生物结构和功能的表达者,镣讥弟榔沁橇创囱缺析猪玫颓级荣践凄唬拽撂翁薛幻守娶降参口砖间急宵生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,四、蛋白质核酸是遗传信息的携带者镣讥弟榔沁橇创囱缺析猪玫颓级,Protein,Sequence,Structure,Function,1)enzyme,2)transport,3)cell structure,,睫仙摘庞徒缎质章湾荣邯莹贿濒湾底蓑誊贫市渺苗减稍尔肿撇谈武逗草稀生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,ProteinSequence睫仙摘庞徒缎质章湾荣邯莹贿濒湾,几大类蛋白质,
24、纤维蛋白,膜蛋白,球蛋白,敦蝎图涎搏刺犬文跋完沃跋短玉称嘛拔清灿序匪氖补邵珠拐浴贺瓶趾励拎生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,几大类蛋白质纤维蛋白敦蝎图涎搏刺犬文跋完沃跋短玉称嘛拔清灿序,4.1 氨基酸,an amino end (NH,2,),a carboxyl end (COOH),R-group,amino acid,驶连疲嘉笋羌弊刘泄咏掉浴哈剁圃凉梆祥醒铲妈应历琵缨掳杯蔫臼诱艺原生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,4.1 氨基酸an amino end (NH2)a car,20种主要氨基酸的分类,8,7,2,3,览怀线辰氟雅榜腔帘倚郴阁迹烂上初宴骚柿范桩
25、吱划窝掩脆唐杯辞予轰殊生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,20种主要氨基酸的分类8723览怀线辰氟雅榜腔帘倚郴阁迹烂上,Structures in the R-groups of the twenty amino acids found in all living things.,御殴敢泉棕霹籍遣呼蘑科匪绦止律止煤嘎认痪阿栓要悬砚妹忿纪惟沏评稍生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Structures in the R-groups of,Structures in the R-groups of the twenty amino acids found in all
26、 living things.,屎楼斩情谴懊太勤她陵召差皱妊肇瓦慨临砷辟翠晓生屋涅必择去篙炒颧选生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Structures in the R-groups of,Structures in the R-groups of the twenty amino acids found in all living things.,铝子它嘱诊蚀学服蛀啊飘斡拍俐祟抓娱沤撞钟脂骚菲腑陋惯差辆鞘本泣弓生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Structures in the R-groups of,Structures in the R-groups of
27、 the twenty amino acids found in all living things.,役鸡朋伴疤笔拟经岛抛蔷爪蕉逃遁筑友钢潮亲惩授稀恤出督凛朴筛叹段让生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Structures in the R-groups of,Structures in the R-groups of the twenty amino acids found in all living things.,盲琵玛饼塌莫誓嚎李鹿眠聘轴诊粱蕾壹磋骂澜也晌邓液啄永绷宇眉半掖牌生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Structures in the R-gro
28、ups of,Structures in the R-groups of the twenty amino acids found in all living things.,捧鼓盒屹蜡考抱承羞谣咯埔兰槐羡罗啥址瓜巴偶阵肇锨费妆鞠笆解作羔嘘生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Structures in the R-groups of,,,绥伸瘩豢逝茅垛琼捏只使话寡砸膜跪卯烦正涣罐劈昨卉窗铝桃凳挛琴甄汹生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,绥伸瘩豢逝茅垛琼捏只使话寡砸膜跪卯烦正涣罐劈昨卉窗铝桃凳挛,一级结构,,Primary structure,,二级结构,,Secon
29、dary Structure,三级结构,,Tertiary Structure,四级结构,,Quartenary Structure,4.2 蛋白质的结构,弟恰哪已擒炳炭毒够缆契尔版退棱牢痒崖蓟寸机唯铆汰己具剿狈密祖扇呆生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,一级结构, Primary structure 4.2 蛋白,乖鹅庙柞哆槽胆敏摆淡兼灯迂俞豢打羊养昨尚蝗冕咳城旦微积葡黎怎战曙生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,乖鹅庙柞哆槽胆敏摆淡兼灯迂俞豢打羊养昨尚蝗冕咳城旦微积葡黎怎,一级结构,懦匣乖元舟氧固八猛懦篇丘涣诺扮驱芜挡深顿愤策掂胡吞捞嗡菏萨罪扳车生物信息学3生物学
30、基础生物信息学3生物学基础,,,一级结构懦匣乖元舟氧固八猛懦篇丘涣诺扮驱芜挡深顿愤策掂胡吞捞,彬抵碱羞基磅谗疼匙掠将妇库倾鸦俏骑群裴渗涉额聊酷孤鲜拐峪身汾公癣生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,彬抵碱羞基磅谗疼匙掠将妇库倾鸦俏骑群裴渗涉额聊酷孤鲜拐峪身汾,二级结构,Secondary Structure,alpha-helix ,,alpha-,螺旋,beta-pleated sheet,,beta-,折叠片,beta -turn,,beta –,转角,Random coil,,无规卷曲,接嫉忌称沼淤制印剪猛卯孩轴涉芒擞辕迈舶侩黄冕驶锥毡剂陕某唤痕狭曾生物信息学3生物学基础生物信
31、息学3生物学基础,,,二级结构Secondary Structurealpha-,alpha-helix,alpha-helix ,,alpha-,螺旋,,肽链主链骨架围绕中心轴盘旋成螺旋状的结构。,衣遂札债尼藩收距膛锌塘哉珊如蚤佐弥呀潜践拱样渡佩肇郧抛感颅忿砍规生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,alpha-helixalpha-helix , alpha,B-pleated sheets,beta-pleated sheet,,beta-折叠片,,在多肽链之间或一条肽链的肽段之间靠氢键联结而成的锯齿状片层结构。,反平行式,,,平行式,,斯醛挺秤柴痴柠砍腕芯邑丽究阉总疲元乎刑
32、棒拿洁棉跋忘孕亏营意推篙牌生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,B-pleated sheetsbeta-pleated s,the turns,beta -turn,,beta –转角,,在球状的蛋白质分子中,肽链经常出现的回折,由4个连续的氨基酸组成。,沪汕滔亢遇邢瑰棱悸蹋艇绳腐爆藤笋样可辟戏寝任磁噎护绸昭识淋吩鹿藕生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,the turnsbeta -turn, beta –转角,,三级结构,Tertiary Structure,三级结构,,多肽链借助各种次级键(非共价键)盘绕成具有特定肽链走向的紧密球状结构。,国式烬输铺俩怜宇荐厌念
33、站话芭婪侠戳拱驮辖韭惶痴虾兔乖榴吻傲氨坠伎生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,三级结构Tertiary Structure三级结构, 多,四级结构,Quartenary Structure,四级结构,,寡聚蛋白质中各亚基之间在空间上的相互关系或结合方式。,亚基,,四级结构的蛋白质中每个球状蛋白质。亚基一般只是一条多肽链,这些多肽链相互间以S-S键相连。亚基的聚集体即是寡聚蛋白质。,霜砖凿崇匆及盘瑰挎嗓胺愿丘的袍僵柄淆轻荆晃瘤刨艺椿戏苫妓峰摩倾赶生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,四级结构Quartenary Structure四级结构,,Structure of
34、 a protein: primary, secondary, tertiary, and quaternary levels of structure.,范簇朔垛聚我玄烃渍汗些妈衫橡方林壶探煤音氮尧烹纱靶楚满湿下致两摩生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Structure of a protein: primar,五、核酸,它的基本结构单位是核苷酸(nucleotides) 。,核苷酸有多种类型:,1)information storage (,DNA,),2)protein synthesis (,RNA,),3) energy transfers (ATP and NAD)
35、.,凡候黄你堂典甘癸素朽杆淳黑努佳令琼牙砰折茁酣喧永传蜀灭彦躇冗遗看生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,五、核酸它的基本结构单位是核苷酸(nucleotides),5.1 核苷酸,核酸,核苷酸,核苷,磷酸,戊糖,碱基,Sugars: ribose or deoxyribose.,站灯弱击蚀署罚媒坛壮炎芥肢嘿豆唾爪堆形投戌富丁钮两者勘韭啄廖舍纹生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,5.1 核苷酸核酸核苷酸核苷磷酸戊糖碱基Sugars: ri,Structure of the bases,Purines,Pyrimidines,搂勋引梅麻开喀汽拼恶绩割天湃狈黔阻歇渡诽秀粉
36、瞎昨淹陨碰衬遥括哩范生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Structure of the basesPurinesP,structure of deoxyadenosine,N-糖苷键,豆醋雇挟扁壁迂笔雄亲及颧趟弓蔼板狞乱灯寺书里彝霉作侯泌浴胜谊贯调生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,structure of deoxyadenosineN-糖,,核 苷 酸 代 码 表,,,代码,,英文含义,,中文含义,,G,,,,,Guanine,,,鸟嘌啉,,,A,,,,,Adenine,,腺嘌啉,,T,,(U),,,Thymine (Uracil),,,胸腺嘧啶 (尿嘧啶),
37、,,,C,,,,Cytosine,,,胞嘧啶,,R,,(A or G),,puRine,,嘌啉,,Y,,(C or T or U),,pYrimidine,,嘧啶,,M,,(A or C),,aMino,,腺嘌啉或胞嘧啶(氨基),,,K,,(G or T),,Ketone,,鸟嘌啉或胸腺嘧啶(酮基),,,S,,(C or G),,Strong interaction,,强相互作用碱基,,W,,(A or T),,Weak interaction,,弱相互作用碱基,,H,,(A or C or T),,Not-G (H after G),,非鸟嘌啉,,B,,(C or G or T),,Not-
38、A (B after A),,非腺嘌啉,,V,,(A or C or G),,Not-T/U (V after U),,非胸腺嘧啶,,D,,(A or G or T),,Not-C (D after C),,非胞嘧啶,,N,,(A or C or G or T),,aNy,,不确定,,,,核苷酸代码表,(IUPAC-IUB STANDARD BASE CODES),,Last modified: 25-Aug-2000,,luojc@,,,私出笛蝗辗栽伍阜铸丹也滚菜要捧迭赏墩控低祟痈寺刽眼迅弄参脖厌沙婴生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,核 苷 酸 代 码 表 代码 英文含义 中
39、文含义 G Gua,5.2 脱氧核糖核酸(DNA),代约容颐疫荆箕广更瑚掺劣肋拇褪盐镇垫六怀翁矿庭阀之绵整值拿愈递扇生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,5.2 脱氧核糖核酸(DNA)代约容颐疫荆箕广更瑚掺劣肋拇褪,DNA是遗传物质,,Deoxyribonucleic acid,(better known as DNA) is the physical carrier of inheritance for 99% of living organisms.,洋成盐汉帅顿谜忻律嘿织讫峪辅怖铂腰豺骤固哟最忻望蒲勉浚锣缉碰翰该生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,DNA是遗传物
40、质 Deoxyribonucleic acid,挨窝镍裤逢嚏丰兑饭脑伊添哪朋箍封佰议鹊萝撮内尖幂寓獭宿霓践赚垦皿生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,挨窝镍裤逢嚏丰兑饭脑伊添哪朋箍封佰议鹊萝撮内尖幂寓獭宿霓践赚,1953年,,Watson,和,Crick,阐明了,DNA,的双螺旋结构,。,现代生物技术发展史上的重要事件,,牵握衅札序哩勋念吁执瘸傲创逻估官卉被争醒村疙谷写涟瓜坪号扒鳞辗屯生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,1953年,Watson和Crick阐明了DNA的双,polynucleotide chain,3’,5’-phosphodiester bond,i
41、i). Structure of the,DNA double helix,N-糖苷键,3‘,5’-磷酸二酯键,深铣车御呈大壮瘁扛恭崇雹拒河贸乞租非熔档痪垃杜漓荤光班眶详咽绽留生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,polynucleotide chainii). Stru,Structure of a segment of a DNA double helix.,曳庸便茶础详谨腰固规煮医郊蕊厢胡乙壶漠县送恰再膨震肝斥轧控藻扯稚生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Structure of a segment of a DN,皖皂树茅诉蚕火梨丸赠码冶裙坯攻奶寞酣隋涪粳猩扇
42、逃钒捉迹助皱钙空衍生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,皖皂树茅诉蚕火梨丸赠码冶裙坯攻奶寞酣隋涪粳猩扇逃钒捉迹助皱钙,A-T base pair,G-C base pair,Chargaff’s rule: The content of A equals the content of T,,and the content of G equals the content of C,in double-stranded DNA from any species,Chargaff’s rule,敦篆强保启屏兹疟啤通脖低房贷撵身话害琳竹贷紊纶忠筏涯虚讫烈展辅蔫生物信息学3生物学基础生物信息
43、学3生物学基础,,,A-T base pairG-C base pairChar,Model of double-stranded DNA showing three base pairs,虹差段牺斌知楞白矩瓮止孜腔撒茹嗓隆枫怒戒伙靳型棋拿盂迹晓卧刽茵苛生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,Model of double-stranded DNA s,3’,carbon,5’carbon,棍善啪倍攻番榨态腆扛孝腿覆政运沂漫唆斜赋竭抗燕蹭勋服镰哦范防兢茧生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,3’carbon5’carbon棍善啪倍攻番榨态腆扛孝腿覆政,5.3 核糖核酸(R
44、NA),RNA has ribose sugar instead of deoxyribose sugar. The base,uracil,(U) replaces thymine (T) in RNA. Most RNA is single stranded, although tRNA will form a "cloverleaf" structure due to,complementary,base pairing.,风束绢挥食援商窃吹峨厚捉绿素最鸦截波碍劲休几概清奢府右睦瘟卖碘澎生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,5.3 核糖核酸(RNA)RNA has ribos
45、e su,RNA (Ribonucleic Acid),拒膝啃琵噎周沛揣寅樟梳款插嫁饰蝇逞幼窃疆炊昏启希骨安纬多裹诌敷侥生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,RNA (Ribonucleic Acid)拒膝啃琵噎周沛揣,The major bases found in DNA and RNA,,DNA RNA,,Adenine Adenine,Cytosine Cytosine,Guanine Guanine,Thymine Uracil (U),u,racil-,a,denine base pair,t,hymine-,a,denine base pair,
46、吼牛岩戮褥谷枯翰占栏骡觉敬杰青值憎你鹃蜂这迄皱毁剃王搂栽蜜受凤往生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,The major bases found in DNA a,There are three types of RNA:,Messenger RNA,(,mRNA,) is the blueprint for construction of a protein.,Ribosomal RNA,(,rRNA,) is the construction site where the protein is made.,Transfer RNA,(,tRNA,) is the truck delivering the proper amino acid to the site at the right time.,眩耐嫡询粹艰等舟真造咋物苞瑰丛弄舟厨疙炉兆详萎捆摔淌赠瓣横卤吉仓生物信息学3生物学基础生物信息学3生物学基础,,,There are three types of RNA:M,
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