GST-Pull-Down原理


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1、分子克隆第三版有详细介绍,结合其中的示意图很容易理解 GST融合蛋白沉降技术利用了 GST对谷胧甘肤偶联球珠的亲和性,从非相互作用蛋白的溶液中 纯化相互作用蛋白。 GST融合的探针蛋白从细菌中表达和纯化,并平行制备细胞裂解液 (可被 35S标记或非标记),再将GST融合蛋白探针和细胞裂解液在谷胧甘肤琼脂糖球珠存在下混合并 孵育,以使蛋白结合。GST融合探针蛋白和任何结合分子被离心收集,获得的混合物经洗涤后, 用过量游离的谷胧甘肤洗脱或直接在 SDS-PAGE上样缓冲液中煮沸。蛋白质经SDS-PAGE分离后 进行下一步的 western印迹、放射自显影及蛋白质染色分析。 GST沉降技术对
2、探测蛋白在溶液 中的相互作用特别有用,而这种相互作用在膜的分析中可能是检测不到的。 GST沉降实验通常有两种应用 :确定融合(或探针)蛋白与未知(或靶)蛋白间 新的相互作用(Kaelin et al. 1991, Grlinick and Chao 1996), 以及证实探针蛋白与已知蛋白质间可 疑的相互作用(例子请见 Posern et al. 199$, Grgureaich et al. 1999, Hunteret al. 1999, Sun et al. 1999)。这两种实验的设计和实施都有所不同。 寓 1 缶曲 ' 在爭猷甘就述灯睛穴耳#需下.■电借白(
3、左】与 祈貫.亞*匸歸持现售瞇U白駅食生甘告.*JG*£fl**-t£/** GST* GST 白金 白.在Bren丙坤tUHUt土廿胃•白槪片进行放盘日鼻 (個不时GSG 啊性的伯号代矗可餐的呻录惟阿*白K・逗一万畫的变功见丈中帝连・ GST pull down 是一种在体外研究蛋白质相互作用的方法,基本原理是这样的:假定 A 蛋白和 B 蛋白可能有相互作用,我们就将其中一个蛋白比如 A 蛋白融合 GST 标签,然后将 GST-A 和 B 以 及能特异结合 GST 的 Sephrose 4B beads 孵育一定时间,然后充分洗涤未结合的蛋白,煮沸 beads 进行
4、 SDS-PAGE 电泳, 然后进行放射自显影 (如果两个蛋白通过体外翻译并且 S35 标记的 话),就可以看见 GST-A和B分别对应的条带, 表明GST-A和B因相互作用而被 GST-A pull down , 如果没有相互作用,就只有 GST-A 相对应的一条带。我们实验室就是这么做的,当然也有细菌 表达 GST-A 蛋白,而 B 蛋白通过细胞裂解液中得到,电泳后直接 western blot 检测。 1、 首先你的目的是 “要检测这两种蛋白是否与寄主细胞之间存在相互作用 ”,也即是说要寻找这 两种蛋白的相互作用蛋白 --- 在寄主细胞表面,也就是说你要寻找的相互作用蛋白是膜蛋白,
5、对 吗? pulldown似乎不是达到你目的的最佳办法,因为你首先要提膜蛋白。而膜蛋白一般都疏水, 量少,好像难以 pulldown 缓冲液系统不适合。我想,你真正的目的是检测寄主细胞表面是否 有你这两个蛋白的受体或配体, 细胞 ELISA 应该可以胜任这个目的。 其他方法你可以在查查看? 2、 如何保证你融合蛋白(细胞提取物)的尽可能大的活性,只有一条:快速、低温纯化。即, 要保证你纯化过程尽量低温,时间尽量短,得到蛋白后立刻冻纯 -70 。当然,你还是有必要做下 你蛋白活性到底丧失有多快。 3、 如果你还是执意要做 pulldown ,最好还是直接买珠子,试剂盒太贵了,不划算。
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