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1、.
蛋白质修饰位点分析
目录
实验目的 2
实验平台 3
实验过程 4
一、“人类connexin43”蛋白质磷酸化位点修饰 4
1、“人类connexin43”蛋白质序列下载 4
2、uniprot数据库查看蛋白磷酸化位点 5
3、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点 6
精品
.
（1）DISPHOS 1.3预测未知蛋白磷酸化位点 6
（2）PhosphoSitePlus预测指定蛋白磷酸化位点 11
4、“人类connexin43”蛋白质磷酸修饰结论 14
二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰 15
2、
1、N型糖基化位点预测 15
2、O型糖基化位点预测 18
（1）哺乳动物O型糖基化位点预测 18
（2）真核生物O型糖基化位点预测 20
3、uniprot数据库查看蛋白质糖基化修饰位点 22
4、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论 22
实验结论 23
（特别提示:ctrl+单击目录下的标题链接，可以跟踪标题；ctrl+单击标题后的图标可以返回目录）
实验目的
l 找出“人类connexin43”蛋白质上面的所有可能磷酸化位点，并说明为什么（注释）
l 找出“人类血红蛋白”上面的糖基化位点，注释结果
实验平台
l uniprot数据库: http://w
3、ww.uniprot.org/(查看蛋白的修饰情况)
l 预测未知蛋白磷酸化位点
DISPHOS: http://www.dabi.temple.edu/disphos/
精品
.
PhosphoSitePlus:http://www.phosphosite.org
l 预测未知蛋白的糖基化修饰位点
N型糖基化位点预测：http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/
O型糖基化位点预测：http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/
http://www.cbs.dtu.dk/services/Yi
4、nOYang/
实验过程
一、“人类connexin43”蛋白质磷酸化位点修饰
1、“人类connexin43”蛋白质序列下载
蛋白序列： fasta.txt
精品
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2、uniprot数据库查看蛋白磷酸化位点
网站链接： http://www.uniprot.org/
精品
.
精品
.
3、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点
（1）DISPHOS 1.3预测未知蛋白磷酸化位点
网站链接：http://www.dabi.temple.edu/disphos/
精品
.
l 开始预测
精品
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精品
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5、
l 结果
DISPHOS由蛋白序列预测蛋白磷酸修饰位点，总共有37个丝氨酸修饰位点，13个苏氨酸修饰位点，16个酪氨酸修饰位点。但是根据打分，只有8个丝氨酸修饰位点可能存在。
精品
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精品
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（2）PhosphoSitePlus预测指定蛋白磷酸化位点
网站链接：http://www.phosphosite.org
l 开始预测
l 结果
筛选参考文献来源多于5篇的磷酸化修饰位点，丙氨酸磷酸化修饰位点数目为1、丝氨酸为17、苏氨酸数目为1、酪氨酸数目为7。
精品
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精品
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精品
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4、“人类conn
6、exin43”蛋白质磷酸修饰结论
在线数据库查询和在线软件预测结果基本一致，“人类connexin43”蛋白质磷酸位点数量相对一般蛋白质较多，且丝氨酸磷酸修饰位点最多。“人类connexin43”蛋白质极有可能是一种活性较高的蛋白质，与机体的生物活性显著相关。
精品
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通过各种文献阅读和网络筛选发现connexin43蛋白质是一种哺乳动物连接蛋白，是主要的细胞缝隙连接蛋白，其表达的异常与多种疾病的发生有关。
二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰
Ncbi下载人类血红蛋白的蛋白序列保存为：hemoglobin.txt
1、N型糖基化位点预测
网站链接：http
7、://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/
l 开始预测
精品
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l 结果
精品
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精品
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2、O型糖基化位点预测
（1）哺乳动物O型糖基化位点预测
网站链接：http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/
l 开始预测
精品
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l 结果
精品
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（2）真核生物O型糖基化位点预测
网站链接：http://www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/
l 开始预测
l 结果
精品
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精品
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3、uniprot数据库查看蛋白质糖基化修饰位点
4、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论
在线数据库查询和在线软件预测结果基本一致，人类血红蛋白基本没有O型糖基化修饰位点,但是存在N型糖基化修饰位点。血红蛋白是高等生物体内负责运载氧的一种蛋白质，糖基化修饰可能和血红蛋白的信号传导功能有关。
精品
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实验结论
人类connexin43”蛋白质磷酸位点数量相对一般蛋白质较多，且丝氨酸磷酸修饰位点最多；人类血红蛋白基本没有O型糖基化修饰位点,但是存在N型糖基化修饰位点。
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精品
蛋白质修饰位点预测详解
